มัสยิดบ้านหลังเกาะตั้งอยู่บนเกาะเล็กๆซึ่งบนเกาะเล็กๆแห่งนี้มีหมู่บ้านอยู่3หมู่บ้านประกอบด้วย บ้านศรีบอยา บ้านคลองเตาะและบ้านหลังเกาะ พื้นเพเดิมของคนหลังเกาะส่วนใหญ่เป้นคนที่มาจากบ้านหาดยาว ซึ่งได้เข้ามาเพื่อทำสวนทำไร่ ครอบครัวแรกๆที่เข้ามาอาศัยได้แก่ครอบครัวของนายจ้อย ฝั่งขวา นายหมาด ฝั่งขวา น้อยบ่อย บ่อหนา นายโสบ คลองรั้ว เป็นต้น ซึ่งในตอนนั้น ในวันศุกร์ท่านเหล่านี้ ต้องเดินทางไปละหมาดญุมอะ ที่มัสยิดเกาะนกคอม ซึ่งต้องข้ามฝาก ข้ามทะเลไปอีกฝั่งหนึ่ง เพราะในขณะนั้นบนเกาะนี้ยังไม่มีมัสยิด ต่อมาเมื่อบ้านเกาะศรีบอยาได้สร้างมัสยิดขึ้น ท่านเหล่านี้ก็ต้องเดินเท้าไปละหมาดญุมอ ะที่มัสยิดบ้านเกาะศรีบอยา เป็นระยะทางกว่า3กิโลเมตร เมื่อเวลาผ่านไปคนในชุมชนบ้านหลังเกาะมีจำนวนมากขึ้น จึงได้มีการสร้างมูซอลลาขึ้น ไว้สำหรับละหมาดประจำวัน และใว้ไช้ในการเรียนการสอน ซึ่งโต๊ะครูที่มาทำการสอนในสมัยนั้น คือฮีจยี ด้าโหด หวันนุรัตน์ มัสยิดบ้านหลังเกาะตั้งอยู่บนเนื้อที่1ไร่กว่าๆ โดยการวกัฟของนายจ้อย ฝั่งขวา มัสยิดได้สร้างขึ้นจากเงินบริจาค เเละจากการเรื่ยไร จากชาวบ้านเป็นส่วนใหญ่ ขอพระองค์อัลลอฮ์ได้ทรงประทานความเมตตา แก่บรรดาบุคคลเหล่านี้ ที่ได้ร่วมกันบริจาคเพื่อสร้างมัสยิด และโต๊ะครูที่ได้ทำการสั่งสอน ที่ได้ล่วงลับไปแล้วด้วยเถิด